تسير المياه الجوفية داخل الفَرَاغَات التي توجد بين الرِّمال والْحَصَى، وتشقُّقات الصخور، وقد تتجمع داخل طبقة صخرية ترقد فوق طبقة من الصَّلْصَال، أو من الصخور الأقل نَفَاذًا للمياه. أما في الطبقات الجيرية، فتتجمع المياه الجوفيّة داخل قنوات وكهوف كبيرة. تتم إعادة اختزان المياه الجوفية عن طريق مياه الأمطار، وذَوَبان الجليد، وترْشيح المياه السطحية إلى أسفل داخل التربة. وتعْتمد معدلات إعادة الاختزان على طبيعة المنطقة وظروف الطقس بها، ونِسْبة الغطاء النباتي على سطح الأرض بها.
