تنمو الطحالب في جميع الموائل تقريبًا في جميع أنحاء العالم . تسكن معظم الطحالب وحيدة الخلية في الماء لكن بعضها يعيش في تربة رطبة. أنواع أخرى من الطحالب تنضم للفطريات لتكوين أشنات . وتشمل أمثلة الموائل غير المائية الينابيع الساخنة ، وسدود المزارع ، والمستنقعات .